宏基因二代测序方法相较其他方法有哪些优劣?
1、二代测序与其他方法相比就如用网捕鱼和鱼竿钓鱼，可将“致病菌、定植菌、罕见菌及未知菌”统统收入渔网。具有无需假设，无偏倚检测，高通量和可检测新的未知病原体。但是劣势就是相对其他方法，价格比较高，解读难度相对较大。
2、宏基因组学研究的对象是特定环境中的总DNA，不是某特定的微生物或其细胞中的总DNA，不需要对微生物进行分离培养和纯化，这对我们认识和利用95%以上的未培养微生物提供了一条新的途径。
3、二代测序和宏基因组的区别在于：二代测序是宏基因组学研究的主要测序方法。以典型的二代测序平台Illumina为例，其测序原理是基于桥式聚合酶链式反应（PCR）的边合成边测序，特点是读长短、准确性高。和一代测序相比，具有测序速度快、准确性高以及成本低的优良特性。
4、②.二代测序 优点： 一次能够同时得到大量的序列数据，相比于一代测序技术，通量提高了成千上万倍； 单条序列成本非常低廉。
5、是对传统Sanger测序（称为一代测序技术）革命性的改变。二代测序技术的核心思想是边合成边测序，可以一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，所以又被称深度测序。由于二代测序技术具有多样本、多位点同时进行测序并且具有较高的覆盖率等优势，在生命科学领域已经被广泛应用。
6、其次，年龄、饮食习惯以及宏基因组中的其他组分等因素也会影响病毒组的组分构成。利用二代测序技术对病毒组进行研究，不仅可以在健康人群和患病个体中发现新的病毒，也可以研究特定疾病与病毒的关系。病毒组研究最有意思的发现之一是病毒与微生物组中的其他组分相互作用，尤其是细菌。
第二代测序技术(NGS)是什么,有什么优势
1、NGS又叫高通量测序，当传统的癌症治疗不起作用，或者医生不能确定患者的癌症起源（原发灶）时，NGS（二代测序）可以帮助确定肿瘤中的基因突变，这些突变可能与某些针对特定变异的药物相匹配。NGS主要优势是通量大，可以得到海量的数据，高通量最小的数据量单位是G，而一代测序一次只能产生1K的数据。
2、NextGenerationSequencing（NGS）技术简介Sanger测序Sanger测序法仍然为基因测序行业内的金标准，但鸟枪测序法在技术上存在瓶颈。
3、高通量测序技术也被称作二代测序技术（Next Generation Sequencing， NGS），这是相对一代测序技术（Sanger Sequencing）而言的，同时由于高通量测序的出现使得我们能对一个物种的基因组和转录组进行全面、细致的分析成为可能，所以又被称为深度测序（deep sequencing）。
4、基因突变，NGS的最基本应用。WES可能出错的地方：探针覆盖不全、测序深度不足、测序错误、重复序列、同源序列等。基本的技术准备：Sanger测序。虽然看起来NGS老牛气了，简直啥都能干。不过老话说得好，十八般武艺样样都通，难免样样稀松。
5、NGS 检测：高通量测序技术（High-throughput sequencing）又称“下一代”测序技术（Next-generation sequencing technology），以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。
6、NGS是Next Generation Sequencing（下一代测序）的缩写，是指一种高通量测序技术，可以在较短时间内同时对数百万个DNA或RNA分子进行测序，用于研究基因组、转录组、表观基因组等各种生物信息学研究领域。NGS检测是利用这种技术进行检测，通常包括对个体基因型、突变、表达谱、蛋白质组等进行测序和分析。
什么是基因二代测序?
第二代测序为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。
即第二代DNA测序技术。第二代测序技术的核心思想是边合成边测序，即通过捕捉新合成的末端的标记来确定DNA的序列，现有的技术平台主要包括Roche/454 FLX、Illumina/Solexa Genome Analyzer和Applied Biosystems SOLID system。DNA测序（DNA sequencing）作为一种重要的实验技术，在生物学研究中有着广泛的应用。
二代测序又称为高通量测序（High-throughput sequencing），是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。关于二代测序的临床应用：二代测序作为一种检测手段，主要应用于基因的生殖变异（遗传性）与体细胞变异（获得性）的检测。
第二代测序（Next-generation sequencing，NGS）又称为高通量测序（High-throughput sequencing），是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序，而二代测序开创性的引入了可逆终止末端，从而实现边合成边测序（Sequencing by Synthesis）。
第二代测序：为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。
普通的二代测序，全基因组或外显子组测序是将DNA分成小片段，然后对各个片段多次读取（一般是三十次）。然而，如果突变只发生在15-20%的细胞中，三十次读取还不足以可靠地捕捉到它们，尤其是当突变只影响一个基因拷贝时。
一代测序和二代测序的区别是什么?
含义不同：第一代测序：指双脱氧末端终止法，扩增后通过毛细管电泳读取序列，每次获取数据量少。第二代测序：为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。
一代测序是上世纪70年代由Sanger和Coulson开创的DNA双脱氧链终止法测序，也称为Sanger测序。在1977年完成第一个基因组序列（噬菌体X174），全长共计5375个碱基。2001年完成的首个人类基因组图谱就是以改进了的Sanger法为其测序基础。
测序速度较第一代，测序成本较第一代低，并且保持了高准确度；（2）测序读段较短，比第一代测序技术的读段要短很多，大多只有100bp~150bp；第三代测序技术 概述：以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore公司的纳米孔单分子测序技术为标志。
优势：二代测序相比一代测序大幅降低了成本，保持了较高准确性，并且大幅降低了测序时间，将一个人类基因组从3年降为1周以内。第三代测序：特点是单分子测序，多基于纳米科技，无需扩增，对单分链DNA/RNA直接用合成、降解、通过纳米孔等方式直接测序，核心特点是无需扩增所以成本更低。
第二代测序：Illumina的突破 Illumina，科技的璀璨明星，以其独特的步骤引领着测序技术的进步。首先，样本通过文库构建，DNA被打断并末端处理，接着adapter连接，PCR扩增使其数量倍增。然后，这些片段在Flowcell（测序芯片）上形成簇，每个簇代表一个独特的DNA片段。
然而第二代测序技术在测序前要通过PCR段对待测片段进行扩增，增加了测序的错误率。而且二代测序产生的测序结果长度较短，需要对测序结果进行人工拼接，因此比较适合于对已知序列的基因组进行重新测序，而在对全新的基因组进行测序时还需要结合第一代测序技术。