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ALK基因检测方法(alk基因检测报告表)

最全梳理ALK基因突变和对应的靶向药物

1、ALK基因融合突变是非小细胞肺癌(NSCLC)常见的一种驱动基因,中国非小细胞肺腺癌中ALK融合突变阳性的比例为3%,在非小细胞肺腺癌、年轻患者(小于60岁)以及不吸烟的人群中发生率较高,ALK阳性的非小细胞肺癌被认为是一种分子亚型,相对应的靶向药物与EGFR分子亚型完全不同。

2、针对ALK融合突变的靶向药物主要包括克唑替尼、艾乐替尼(Alectinib)、色瑞替尼(Ceritinib)、Brigatinib(AP26113)以及劳拉替尼(Lorlatinib,PF06463922)等。克唑替尼是首个用于治疗ALK阳性NSCLC的靶向药物,其客观缓解率高达60%,无进展生存期为8-10个月,总生存期也有显著延长。

3、目前,FDA批准的ALK突变非小细胞肺癌靶向治疗药物共有五款,包括劳拉替尼、艾乐替尼(阿来替尼)、色瑞替尼(赛瑞替尼)、布加替尼和克唑替尼。劳拉替尼作为唯一一款第三代ALK抑制剂,曾是最有效的后线治疗选择之一,现在作为一线治疗药物,为脑转移患者提供了更有效的新选择。

4、目前,已经获得FDA批准应用于ALK突变非小细胞肺癌患者的靶向治疗药物共有五款,除劳拉替尼以外,艾乐替尼(阿来替尼)、色瑞替尼(赛瑞替尼)、布加替尼、克唑替尼四款药物均被NCCN指南列为一线单药治疗方案。

ALK基因检测是什么?

ALK是非小细胞肺癌(NSCLC)常见的一种驱动基因,中国NSCLC突变阳性率3%。ALK融合基因突变主要在肺腺癌里常见,一般肺鳞癌患者ALK融合基因突变概率很低。有研究说亚裔的EGFR、KRAS野生型的腺癌患者,ALK阳性比例高达30%-42%,因此如果发现EGFR和KRAS是野生型,是更有必要测下ALK基因的。

对于晚期非小细胞肺癌,推荐所有腺癌或含腺癌成分的非小细胞肺癌患者,在诊断时常规进行ALK融合基因或ALK融合蛋白检测。 对于小活检标本或者不吸烟的鳞状细胞癌患者也建议进行ALK基因检测。ALK融合基因的产物是分子量为80 kD的融合肿瘤蛋白,其转化细胞的能力已得到公认。

ALK阳性肺癌患者指的是被检测出ALK突变阳性的肺癌患者。这种突变在3—5%的非小细胞肺癌的人群中发生。乍看起来,这似乎是一个非常小的数字,但是考虑到美国每年有大量的被确诊为肺癌的患者。这个人数实际上是非常大的。这种融合基因也被在神经母细胞瘤和间变性大细胞淋巴瘤的患者中被发现。

所以也有说法ALK是一种钻石突变。但需要谨慎的是不是每一个劳拉替尼耐药的患者都这样。我们从图示看出患者同时存在C1156Y和L1198F突变,才造成了这种逆转。也许其他的突变位点如L1196M等和L1198F就没有这种协同效果。

对于小活检标本或者不吸烟的鳞状细胞癌患者也建议进行ALK基因检测。2009年Shaw等将ALK基因重排阳性的肺癌列为非小细胞肺癌的一个特定分子亚型。ALK融合型非小细胞肺癌不仅是基因序列层面的改变,ALK融合蛋白也是该类疾病中重要变异,因此将此类疾病统称为“ALK阳性非小细胞肺癌”。

EML4-ALK融合基因检测为什么用RNA逆转录

换言之, 全转录组测序可以被理解为天然的“WES”,但是由于基因的差异化表达,转录本覆盖会参差不齐,同时又限于实验技术(去核糖体、逆转录等)和生物学(mRNA前体)方面的影响,最终可能需要大量的数据量来提升RNA-seq对融合基因的检测灵敏度和稳定性(图4)。

另一个重要的例子是在非小细胞肺癌中检测EML4-ALK融合基因。随着越来越多的免疫疗法被开发和批准,研究人员试图用FISH来预测癌症免疫治疗的反应性。 为了扩大FISH的有效性,可以将FISH与IHC或IF结合起来,同时检测不同细胞类型的RNA和蛋白质,以更好地表征肿瘤微环境(TME)。

此外,研究人员采用包含9种已知的EML4-ALK融合转录物,和ALK RNA水平的多重逆转录聚合酶链反应,检测大规模筛选4500例非小细胞肺癌患者福尔马林固定石蜡包埋组织后报告了2%ALK阳性率。回顾性组织库研究显示,ALK基因重排非小细胞肺癌的发生约占非小细胞肺癌的3%-5%,不同种族的发生率无明显差异。

肿瘤个体化治疗的ALK基因靶点检测方法

ALK融合基因的产物是分子量为80 kD的融合肿瘤蛋白,其转化细胞的能力已得到公认。P80NPM-ALK通过使大鼠纤维母细胞发生锚非依赖性(anchorageindependent)生长,增殖率明显增高;此外,它还可使Ba/F3细胞转变为IL3非依赖性。

表1:ALK基因检测的方法 需要注意,临床常用的三种方法是FISH、Ventana IHC及RT-PCR,三种方法FISH的灵敏度最低。因此,如果是胸腔积液、细针穿刺取到的细胞学样本做成的蜡块,不建议使用FISH,避免假阴性。另外通过抽血检测循环肿瘤DNA(ctDNA),循环肿瘤细胞(CTC)也正在发展起来。

ALK融合突变的检测方法多样,包括FISH、Ventana IHC及RT-PCR等。需要注意的是,FISH方法在某些情况下可能产生假阴性结果,例如在胸腔积液或细针穿刺细胞学样本制成的蜡块中,因此并不推荐使用FISH。此外,通过血液检测循环肿瘤DNA(ctDNA)和循环肿瘤细胞(CTC)的方法也在不断发展中。

耐药原理:肿瘤通过另外一些机制来激活其他信号通路,取代对ALK及下游信号的依赖。如EGFR突变或磷酸化、KRAS突变和c-KIT扩增等。应对策略:根据旁路激活的基因情况,考虑使用联合靶向药物治疗。

胁人类的三大癌症肺癌,胃癌,肝癌。肺癌的发病率相对较高,肺癌是由于肺功能紊乱,已经完全不能按照人体所需来工作,肺癌早期的话可以通过手术进行治疗,有康复的几率,如果发展到晚期希望就非常渺茫了,只能说是延长他的生命周期,具体还是需要咨询主治医师的。

IHC20-1798肿瘤细胞ALk(+)是什么意思?

alk是间变性淋巴瘤激酶的意思,ALK是间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase )的英文缩写,其突变形式有过量表达、与其他基因形成融合基因、发生点突等。

ALK融合基因的产物是分子量为80 kD的融合肿瘤蛋白,其转化细胞的能力已得到公认。P80NPM-ALK通过使大鼠纤维母细胞发生锚非依赖性(anchorage independent)生长,增殖率明显增高。它还可使Ba/F3细胞转变为IL3非依赖性。

ALK是英文“Anaplastic Lymphoma Kinase”的缩写,意为“非结构性淋巴瘤激酶”。在医学领域,ALK通常指的是一种基因突变类型,与多种恶性肿瘤有关,包括肺癌、淋巴瘤和神经母细胞肿瘤等。网络上经常提到ALK检测和ALK抑制剂等术语,都是与医学领域相关的话题。除了在医学领域,ALK在网络用途上也有一定的涉及。

IHC指的是免疫组化染色技术,是一种检测肿瘤组织中蛋白质表达的方法。肿瘤细胞往往会表达一些特殊的蛋白质,通过IHC技术,可以对这些蛋白质进行检测和鉴定。一般来说,IHC技术可以帮助医生诊断肿瘤、了解肿瘤的分子特性等。因此,IHC技术在肿瘤诊断、治疗和预后判断中有着重要的应用价值。

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