分析重组单株,精细定位基因,这样做更高效
1、重组单株筛选的必要性基因定位的基石在于理解标记与基因的紧密关系。通过分析重组单株，我们能逐步缩小目标基因的区间，实现精细定位。这是因为重组交换单株的分析，如同在地图上缩小搜索范围，直到找到精确的坐标。
2、通常QTL粗定位所需群体较小，一般200个左右株系的群体即可，RIL、DH和F3等群体都可以进行；精细定位通常需要群体要大，一般需要上千个株系，有的甚至上万，对于质量性状基因选用F2群体的单株进行分析，而数量性状基因则需利用RIL或DH群体的粗定位结果进行次级群体的构建，然后才可进行基因的精细定位。
3、然后筛选大量两亲本间存在差异的标记，包括分子标记和表型标记等 下面要在对群体的每一个系（如果是F2群体就是每一个单株）进行全部标记的分析，（PCR扩增电泳，蛋白质电泳等等）。最后把所得所有数据进行连锁性分析（有现成的软件，比如mapmaker），得到包含你要找的基因在内的若干个连锁群。
4、项目组使用分子符号检测研发了居群搜集技能，设定居群遗传多样性阈值，结合遗传多样性分析，制定了取样间距以及取样数量的规范。战胜了以往凭经验随机取样，取样单株少，代表性差等问题。使用分子符号剔除重复后取得野生稻资源19153份，是我国1996年保存总数（5599份）的42倍，极大地丰富了我国野生稻基因库。
5、NIL群体即近等基因系群体，群体内不同个体的染色体绝大部分区间完全相同，只有少数几个或一个区间彼此存在差异；NIL群体可以将多个QTL位点分解成单个孟德尔遗传因子，将数量性状转化为质量形状，从而可以对主效QTL进行精细定位和图位克隆。DH群体是配子基因型经染色体加倍形成的，不同个体基因型稳定，属于永久作图群体。
染色体微阵列分析和基因检查一样吗
都属于二代测序技术，微阵列用的是芯片，高通量不用。但得到的结果是一样的。在染色体方面的检查结果都很准确。
核型看结构，微阵列是CNV的一种检测方法。常见的是CMA和CNV-seq，各有特点。CNV是指拷贝数变异，通俗点理解就是查染色体的细节，有没有缺失或者重复。全外显子是指对基因的外显子进行检测。是分子级的检测技术。
染色体分析直接检测染色体数目及结构的异常，而不是检查某条染色体上某个基因的突变或异常。通常用来诊断胎儿的异常。常见的染色体异常是多一条染色体，检测用的细胞来自血液样本，若是胎儿，则通过羊膜穿刺或绒毛膜绒毛取样获得细胞。将之染色，让染色体凸显出来，然后用高倍显微镜观察是否有异常。
基因芯片：又称染色体微阵列芯片（CMA），可进行全染色体组扫描，一次实验可检测包括染色体非整倍体、大片段缺失/重复等多种染色体畸变，同时可检出传统核型分析无法识别的微小结构异常（微缺失/重复、额外标记染色体等）、单亲二倍体、杂合性缺失、嵌合体等信息，分辨率较核型分析提高了近1000倍。
染色体微阵列分析 （chromosomal mlcroarray analysis，CMA） 技术又被称为“分子核型分析”， 能够在全基因组水平进行扫描，可检测染色体不平衡的拷贝数变异（copy number variant，CNV）， 尤其是对于检测染色体组微小缺失、重复等不平衡性重排具有突出优势。
基因检测方法有哪些
一般有三种基因检测方法：生化检测、染色体分析和DNA分析。生化检测 生化检测是通过化学手段，检测血液、尿液、羊水或羊膜细胞样本，检查相关蛋白质或物质是否存在，确定是否存在基因缺陷。用于诊断某种基因缺陷，这种缺陷是因某种维持身体正常功能的蛋白质不均衡导致的，通常是检测测试蛋白质含量。
小卫星DNA和微卫星DNA的长度多态性可以通过PCR扩增后电泳来检出，并用于致病基因的连锁分析，这种诊断方法称为扩增片段长度多态性（amplified fragment length polymorphism，Amp-FLP）连锁分析法。PCR扩增后，产物即等位片段之间的差别有时只有几个核苷酸，故需用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离鉴定。
免疫组织化学方法：如果是基因蛋白表达的检测，也就是采用免疫组织化学的方法进行检测，往往需要2-3天的时间。PCR测序：如果某些基因可以通过PCR测序进行检测，可能也需要1-3天的时间。NGS测序：如果癌症的基因检测是采用高通量（NGS）测序，常常需要7-10个工作日的时间。
生化检测：通过化学手段，检测血液、尿液、羊水或羊膜细胞样本，检查相关蛋白质或物质是否存在，确定是否存在基因缺陷。用于诊断某种基因缺陷，这种缺陷是因某种维持身体正常功能的蛋白质不均衡导致的，通常是检测测试蛋白质含量。还可用于诊断苯丙酮尿症等。
【基因检测方法比较】基因检测方法有哪些基因检测技术原理第一代测序1Sanger测序采用的是直接测序法1977年，FrederickSanger等发明了双脱氧链末端终止法，这一技术随后成为最为常用的基因测序技术。2001年，AllanMaxam和WalterGibert发明了Sanger测序法，并在此后的10年里成为基因检测的金标准。
基因筛检 主要是针对特定团体或全体人群进行检测。大多数通过产前或新生儿的基因检测以达到筛检的目的。生殖性基因检测 在进行体外人工授精阶段可运用，筛检出胚胎是否带有基因变异，避免胎儿患有遗传性疾病。诊断性检测 多数用来协助临床用药指导。